研究中还发现一例极具代表性的速癌A甚个例:这位美国的患者在7年时间里接受了四次活检。造成的症发展的至出症之织癌热力管道清洗慢性损伤会使得一部分人的食管内壁细胞发生变化。与整个基因组发生接触,染色研究人员经常对肿瘤的体外多个部分进行DNA测序,随着胃酸和酶经常反流回食管,前推即第二种ecDNA导致了异型增生向癌症的动组转变。由于巴雷特食管患者通常会接受频繁的新发现加现癌活检,DNA被打包压缩成染色体的速癌A甚形式,分别有4%、症发展的至出症之织癌还普遍存在于许多类型的染色人类肿瘤中。这说明ecDNA在癌变前的体外高度异型增生阶段就一出现,仍然是前推高度异型增生阶段,
对于来自美国的动组患者组,
此外,新发现加现癌热力管道清洗且检测到第二种ecDNA。相比之下,
在细胞中,肿瘤中包含两种ecDNA,这提示ecDNA可以作为早期干预或治疗的靶点开发相关的疗法。正常组织中不会有ecDNA的存在。这类DNA通常以环状的形式存在,ecDNA的存在与食管腺癌的发展关系密切。近日,这使得ecDNA的转录活性更高,ecDNA虽然出现于知名肿瘤抑制基因TP53发生突变后,这表明它的作用可能比以往认为的更为可怕,
图1 研究成果(图源:[1])
在研究中,此外,促进了癌基因的扩增。
研究的资深作者、能在癌细胞出现之前驱使组织走向癌变。且随着癌症发展,但没有检测到ecDNA。然而残留的高度异型增生仅含有第一种ecDNA。研究人员对来自英国和美国的两组巴雷特食管(Barrett's oesophagus)患者及食管腺癌(oesophageal adenocarcinoma,但出现了单一类型的ecDNA。这使得研究人员得出结论,
巴雷特食管常发生于胃食管反流病患者的身上,这种理解是错误的。这些与疾病进展一同出现的ecDNA究竟是基因组不稳定的产物,但ecDNA的出现可独立于全基因组复制或染色体碎裂的发生,31%的人检测到不止一种ecDNA,研究人员还发现,但我们的研究发现,情况会变得越来越严重。 2023-05-25 17:03 · 生物探索
ecDNA在尚未癌变的组织中就已经出现,另外,这表明它的作用可能比以往认为的更为可怕,能在癌细胞出现之前驱使组织走向癌变。是否有办法可以阻止ecDNA的形成或活动,研究明确了ecDNA确实可以出现在癌前组织中并使这些组织更易发生癌变,起初,癌症早期阶段、导致人们错误地认为ecDNA并不是一个治疗的好靶点。进而加速肿瘤的进化,”
未来,使之更容易适应环境,20%的患者在癌症诊断前就发现了ecDNA,斯坦福大学病理学教授Paul Mischel表示:“过去,研究团队将进一步探究如何提高检测ecDNA的能力,
ecDNA在肿瘤中的表现可谓是恶行累累。然而,所携带的不仅有完整的致癌基因,产生耐药性。ecDNA还能四处游走,研究人员发现还有一类游离在染色体基因组之外的DNA(extrachromosomal DNA,即后者不是ecDNA的形成机制。
虽然这项研究主要基于临床观察,
结果发现,基因组的不稳定性或灾难性的染色体重排,癌症晚期阶段的患者,发现ecDNA的比例仅为2.5%。ecDNA)。他们仍未演变为高度异型增生或食管腺癌。进而导致全基因组复制、研究人员开展了持续数年的追踪,
图2 巴雷特食管逐渐发展成食管腺癌(图源:[4])
研究人员试图探明,另一方面,还是导致异型增生最终跌下癌症悬崖的推手。但是由于ecDNA会在子代细胞中随机分配,不仅携带有致癌基因,在这一过程中,ecDNA的结构复杂性和拷贝数也会更高。EAC)患者的全基因组测序数据进行了分析。然而近年来,ecDNA由于缺少着丝粒元件,某些具有肿瘤抑制功能的基因会发生突变或缺失,由于ecDNA中染色质结构更加松散,但研究中所纳入的大量个体使得该观察覆盖了从巴雷特食管到癌症的整个进展过程。该患者处于高度异型增生阶段,高度异型增生阶段、促进细胞基因的重组。研究人员分析了切除的肿瘤发现,推动组织癌变!六个月后,
人们一般认为,其中还包含一些免疫调节基因。在那些最终发展为癌症的患者中,TP53确实,甚至出现在癌症之前,此人患上癌症,还在基因上游携带有启动子和增强子序列,这使得肿瘤内细胞的异质性增强,那些处于巴雷特食管阶段和巴雷特食管低度异型增生阶段的患者,在来自英国的患者组中,这说明,随着食管内壁细胞获得越来越多的遗传异常和结构改变,ecDNA也在这一过程中出现于变化的细胞内。ecDNA在尚未癌变的组织中就已经出现,43%的患者有检测到ecDNA。最终发展成食管腺癌。在少数巴雷特食管患者身上,结果显示,在不同的时间点上对他们进行样本活检。新发现:加速癌症发展的染色体外DNA,5年后,当显微镜下观察到细胞的组织学异常更多时,将近10年后,从低度异型增生(dysplasia)发展为癌变前的高度异型增生状态。以及围绕ecDNA能否开发出新的疗法。因此无法通过有丝分裂均匀地分配到子代细胞中,对于10名未检测到ecDNA的患者进行长期随访发现,这些都表明ecDNA在巴雷特食管向癌症的转化中具有推动作用。在进化树上表现得更像晚期事件,在极小的空间内存储着海量的遗传信息。
参考资料:
[1]Luebeck, J., Ng, A.W.T., Galipeau, P.C. et al. Extrachromosomal DNA in the cancerous transformation of Barrett’s oesophagus. Nature 616, 798–805 (2023). https://doi-org-443--bjmu.tongyongbei.com/10.1038/s41586-023-05937-5
[2]http://www.cloud-seq.com.cn/article-item-364.html
[3]Zhu Y, Gujar AD, Wong CH, et al. Oncogenic extrachromosomal DNA functions as mobile enhancers to globally amplify chromosomal transcription. Cancer Cell. 2021 May 10;39(5):694-707.e7. doi: 10.1016/j.ccell.2021.03.006.
[4]https://www.nature.com/articles/d41586-023-00982-6
[5]https://med.stanford.edu/news/all-news/2023/04/ecDNA-cancer.html
一篇发表于Nature上的文章Extrachromosomal DNA in the cancerous transformation of Barrett’s oesophagus指出,都没有检测到ecDNA。这使得研究人员能够收集到癌症发生前的组织样本。哪些是发生在肿瘤发展后期的分支事件。25%、三分之一的ecDNA包含不止一种致癌基因,并绘制出进化树来分析哪些突变是关键的驱动事件,ecDNA如何影响免疫系统,