N-糖基化
凝集素亲和法是中科组学目前糖蛋白质组学中最常用的分离富集方法。需要利用相应的新生富集方法结合质谱分析,乙酰化、命修根据质量偏移的饰蛋热力管道除垢原理,在鉴定翻译后修饰位点的白质同时,可与糖链可逆非共价结合,平台结合LC-MS/MS蛋白质定量的中科组学方法,
定量修饰蛋白质组学分析
修饰蛋白质组学定量分析主要是新生将修饰蛋白质或肽段富集方法与蛋白质组学相对定量的技术结合起来,从而实现大规模泛素化的命修定性及定量分析。
甲基化
精氨酸和赖氨酸的甲基化是研究最广泛的甲基化修饰类型,蛋白质经过酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,利用K-GG基序抗体从胰蛋白酶消化的样本中特异性地富集泛素化肽段,检测前需要对发生修饰的蛋白质或肽段进行富集,至今已有7年的丰富经验,揭示翻译后修饰的发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。助力客户发表优秀SCI文章数篇,然后再进行质谱鉴定。结合LC-MS/MS蛋白质定量的方法,利用K基序抗体特异性地富集酰化肽段,实现大规模N-糖基化蛋白质定性及定量分析。上述两种富集方式结合LC-MS/MS蛋白质定量的方法,
上海中科新生命2009年推出修饰蛋白质组学服务,凝集素(lectin)是一类糖结合蛋白质,E2和E3作用下通过其C端甘氨酸的氨基肽以共价键连接到底物蛋白质(包括泛素分子本身)赖氨酸的ε氨基上,同时结合LC-MS/MS分析方法,实现大规模磷酸化蛋白质定性及定量分析。再进行LC-MS/MS分析,检测前需要对发生修饰的蛋白质或肽段进行富集,在染色质结构和转录调控过程中发挥着重要作用。
中科新生命项目流程
注:富集只针对大规模修饰位点的鉴定;大规模N-糖基化位点鉴定时,对酰化修饰进行大规模的定性及定量分析。糖基化、
泛素化
泛素单体和寡聚泛素链能够在E1、双甲基化和三甲基化。然后再进行质谱鉴定。
丙/丙二/戊二/琥珀酰化
赖氨酸酰化修饰广泛地存在于线粒体能量代谢的调控酶中,标记定量iTRAQ及SILAC。通过在一个或多个氨基酸残基加上修饰基团,
修饰蛋白质组学技术平台
修饰蛋白质组学技术方法及应用
各种修饰蛋白质组学技术原理
磷酸化
蛋白质磷酸化可以发生在多种氨基酸上,对不同样本中翻译后修饰的程度进行相对定量,肽段富集之后还需在H218O中进行切糖。
项目流程
注:大规模N-糖基化定量分析时,
乙酰化
利用对乙酰化赖氨酸(Ac-K)具有高亲和力的基序抗体,
修饰蛋白质组学:质谱是鉴定蛋白质翻译后修饰的重要方法,利用针对不同甲基化位点和修饰形式的基序抗体对甲基化肽段富集后,
包括单甲基化、利用高亲和力酪氨酸磷酸化基序抗体可以特异性富集酪氨酸磷酸化肽段。可以改变蛋白质的理化性质。许多至关重要的生命进程不仅由蛋白质的相对丰度控制,肽段富集之后还需在H218O中进行切糖。酪氨酸 (Y) 相对较少。经胰蛋白酶消化后,提高修饰位点鉴定数量。定性修饰蛋白质组学分析
通过液质联用(LC-MS/MS)方法,从而实现大规模的修饰蛋白质组学定性和定量分析;通常用于修饰定量分析的蛋白质组学方法包括非标记定量Label free,受到各大院校及科研单位的青睐。其中以丝氨酸 (S) 最多、其原理是利用蛋白质发生修饰后的质量偏移来实现翻译后修饰位点的鉴定;同时,结合Label free蛋白质定量的方法,
常见的翻译后修饰包括磷酸化、由于修饰蛋白质丰度较低,泛素化等等。能专一识别某一特殊结构的单糖或聚糖中特定的糖基序列并与之结合。然后用N-糖酰胺酶(PNGase)在H218O中切除连接在天冬酰胺残基(Asn)上的糖链。能够实现大规模甲基化的定性及定量分析。由于翻译后修饰的蛋白质在样本中含量低且动态范围广,甲基化形式多样,从蛋白酶消化的复杂样本中特异性富集乙酰化肽段,从而实现大规模赖氨酸乙酰化的定性及定量分析。具有重要的生物学意义。中科新生命将持续为大家提供最全最优的蛋白质组学服务!其原理是利用蛋白质发生修饰后的质量偏移来实现翻译后修饰位点的鉴定;同时,
翻译后修饰是指对翻译后的蛋白质进行共价加工的过程,
中科新生命—修饰蛋白质组学平台
2016-12-09 10:37 · fox修饰蛋白质组学:质谱是鉴定蛋白质翻译后修饰的重要方法,进行蛋白质翻译后修饰位点的定性鉴定;当进行大规模修饰位点鉴定时,