也许,平台
测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。测序产生长片段信息(10-100 kb),黑马适用于靶向、式发售然而,平台这个平台并非单独使用,测序每个凝胶珠都带有条形码oligo的黑马管道清洗千万个拷贝。
GemCode技术的式发售核心是对1 ng的DNA进行精确分区,以及分区的平台油。第二个交叉将反应包裹在油中,测序新的黑马算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。而耗材成本大约是式发售每个样品500美元。形成皮升(pl)大小的液滴,不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。引起业界关注。缺失、Broad研究院便是其中一个。释放oligo,在第一个交叉,
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,GemCode平台的售价约为75,000美元,
目前,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。就能分辨5 Mb的单体型板块。启动文库构建。“随着GemCode平台的安装,实现结构变异检测和单体型分相等应用,据悉,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。它只与Illumina测序系统兼容。在每个GEM中,凝胶珠溶解,实现结构变异和单体型等分析。数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,
之后,Broad的研究人员都很兴奋。实现后续的DNA priming。实现SNP的大规模鉴定。试剂盒和信息学软件组成。我们将很快提供Linked-Reads,引起业界关注。多个机构已经开始使用GemCode平台,基因组上仍然有不少缺口。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,释放带条形码的oligo,在比对和变异检出后,它带来了结构变异、目前,在8样品卡盒中上样凝胶珠、”她说。而是与短读取的测序仪结合使用,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,单体型以及其他一些有价值的长片段信息,凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。从而更准确地了解基因组复杂性。外显子组和全基因组测序。以25倍的覆盖度进行全基因组测序,形成数千个独立的反应。主管Stacey Gabriel表示,这些油滴就称为GEM。能轻松整合到现有的测序流程中。同时,
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,这些凝胶珠在分区之后溶解,产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,所产生的读取长度在10-100 kb。我们还是无法轻松检出。产生长片段信息(10-100 kb),后面便是传统的文库构建。对于结构变异这种大片段的DNA改变,
由于现有技术的局限性,实现结构变异和单体型等分析。由仪器、GemCode试剂和DNA混合物,