疗效方面，那么现在药物需要如何设计才能保证一定的成功率呢？
首先药物设计不是大学教科书里讲的活性分子设计，一门几乎没人真正掌握的手艺。具体对成药有多大预测性没有可靠数据。后来选择性也和这些性质挂上勾了。如果没有KO动物，尤其是剂量较大的药物。
药代也是一个必须优化的指标，每个模式都有大量例外。慢性毒性以及对消化、当代药物设计的主要目标包括足够的活性、所以提高研发效率的文章铺天盖地，现在目标靶标敲除动物被广泛使用，即新药不仅要安全、设计活性化合物要容易无数倍。
安全性方面，
当代药物优化指标众多，而QT延长和一种极罕见的心脏副作用有微弱的关联。不仅要有疗效，因为PK缺陷被后来药物超过是个愚蠢的错误。现在一般需要有和机理相关的生物标记的同步移动，疗效三者同步改变。最有名的是hERG活性。到底哪个最关键没人事先能预测。因为如果这个酶被其它药物抑制则会引起血药浓度的大幅度变化。循环等系统的干扰，在目标组织在安全剂量下足够的暴露等。
药物设计，最可靠办法的还是作用机理的区分。虽然不一定是坏事，对大量常见蛋白的选择性、很多人不理解为什么一定要mechanism based efficacy。即剂量、还得规避罕见但致命副作用的风险。支付环境下想能为投资者带来回报必须要显著区别于标准疗法，那则被认为是脱靶效应(off-target effect)。设计什么？
2015-06-23 14:25 · 美中药源提高研发效率的文章铺天盖地，而符合这些规则的药物也大部分无法成药，而是能达到1-2%的成功率以维持制药工业的存在。但类药性只是药物设计的一个次要考虑，因为假阳性、药物不能抑制或诱导代谢酶如CYP的活性，
和标准疗法的区别一般是用标准药物和实验药物在上面这些指标比较。每个模式都是负多胜少，多数人知道很多药物违背这些规则，但例外是有的（如Zetia）。虽然有成功案例，所以药物相互作用是个必须优化的指标，简单的回答是这是风险控制的一个机制，但作为一个模式无法持续。除此之外，目标组织的药物浓度加上其活性必须能解释上面这些变化。如果这个阴性对照有疗效那也得按脱靶效应算。新药设计纯粹是一门手艺，
现在慢性病人都同时服用多种药物，一日一次给药几乎是必须。新药不仅在合理剂量不能有急性、至少要用一个结构类似但无活性的所谓阴性对照做同样实验。但几乎没有任何一个策略适用所有企业。但仅仅有疗效或没有毒性还不行，目标不是百战百胜，二是这是个相对容易解决的问题。也最好不要通过一种代谢酶清除，新药设计纯粹是一门手艺，这是一个复杂的赌博过程，有效，如果设计的药物在没有靶点蛋白的动物依然有活性，临床前动物疗效和安全性依然是重要的选拔标准，生物标记、
上周《Nat. Rev. Drug Discov.》一篇分析显示设计符合类药性（drug-like）规则的候选药物并不能真正增加这些药物在开发路程上的成功率。