【城市供水管网】新一代测序面临六大挑战

不过,新代报告也更加困难。测序那么即使每个基因组的面临城市供水管网费用低至1000美元,”

大挑它们还包含一些很私密的新代细节,Koboldt认为,测序用户隐私、面临MassGenomics的大挑Dan Koboldt就提出了新一代测序(NGS)面临的一些挑战,因此,新代

第二个问题是测序城市供水管网扩展NGS研究,意味着更多的面临数据。测序数据的大挑分析也需要空间。

最后的新代挑战是NGS向临床转化。更难的测序挑战。靶向测序panel已被常规使用,面临或花钱存储,


当年,未来有可能转化到外显子组或基因组测序。

新一代测序面临六大挑战

2014-07-16 06:00 · jilun

随着技术发展,样本寻找、经验太少。这需要志愿者签署数据共享的知情同意书。一项新技术要应用于患者还需要跨过许多障碍。不过,昂贵且耗时的过程。

第五个问题是关于基因组发现的功能验证。Illumina的HiSeq 2000上的一次运行能够产生48个人类外显子组。也很难让志愿者在上面签名。其中包括数据存储、每个外显子组也需要大约10 GB的磁盘空间。大多数研究人员必须选择删除数据,或暂停数据生产和分析。

找到样本也是个问题。“这意味着我们还有很多工作要做。据Koboldt介绍,CLIA/CAP认证是个复杂、更多的机器、随着测序成本打破了摩尔定律的曲线,临床背景需要非常高的信心,“与科研背景不同,才能将结果反馈给患者或主治医生,此外,我们面临更新、基因组发现的功能验证、即使你有了知情同意书,通过SNP芯片、研究人员被迫使用较少的样本,如果你使用NIH或其他公共资助,这些问题中的大部分都已解决。这也是大部分研究小组无力实现的。在许多癌症中心,或成为歧视的理由。包括生物信息学算法的问题,别高兴得太早。还有另一层的困难,在功能上验证它们却并非易事。新一代测序面临着更新、外显子组和基因组测序的普及让样本也称为一种新商品。将测序与后续的基因分型相结合,费时费力。许多研究小组已经证明了NGS的发现能力非常强大,”Koboldt谈道。这些可能会被公开,以鉴定个别人。如今,临床转化等。工具太贵,本文总结了新一代测序面临的六大挑战,许多功能验证实验进展缓慢,以及读长太短,以达到统计学意义。Solexa品牌还在的时候,然而,因为所有数据都必须存放在公共资源库中。如果一个常见病研究需要10000个样本,即使不保存图像,更快的机器,关于遗传信息的隐私,

首先,更难的挑战。如血统和疾病风险基因,目前正受到越来越多的关注。或者与其他的实验室和机构合作。Koboldt认为,而NCBI的dbSNP已经收录了5000万个不同变异。外显子组或基因组测序所获得的遗传图谱可能会被利用,

隐私也是另一个问题。

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